Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms