Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms