Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms