Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms