Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3IPQ96QF0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms