Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms