Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRT1Q96EB6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms