Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms