Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC9Q92623 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC9Q92623 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9Q92623 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC9Q92623 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC9Q92623 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC9Q92623 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC9Q92623 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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