Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms