Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms