Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms