Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL4L1Q8NHW4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms