Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms