Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM25Q86YD3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms