Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms