Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms