Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms