Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms