Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms