Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RWDD4Q6NW29 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms