Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms