Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms