Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms