Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms