Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms