Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms