Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CDCA8Q53HL2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms