Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLEKHN1Q494U1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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