Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms