Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms