Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms