Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms