Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms