Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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