Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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ZNF239Q16600 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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ZNF239Q16600 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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