Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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