Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms