Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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