Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms