Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
USF2Q15853 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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