Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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