Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms