Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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