Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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