Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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NECTIN1Q15223 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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NECTIN1Q15223 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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