Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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