Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RFTN1Q14699 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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