Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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