Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SEMA3AQ14563 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SEMA3AQ14563 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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